- 2000年9月会社設立
- 10月「MR君」提供開始
- 2002年3月ウェブエムディ株式会社より、医療情報サイト「WebMD Japan」の運営を引き継ぐ
- 8月調査サービス「リサーチ君」提供開始
医療情報サイト「WebMD Japan」を「so-net m3.com」に名称変更
- 2003年1月ソニーコミュニケーションネットワーク株式会社（現 ソネットエンタテイメント株式会社）より、医療情報サイト「MediPro/MyMedipro」を営業譲受
- 2月医薬品マーケティング業務一括代行サービス「MR君eCSO」提供開始
- 7月並行して運営してきた「MyMedipro」と「so-net m3.com」の２つの医療情報サイトを統合、医療専門サイト「m3.com」運営開始
- 10月So-net M3 USA Corporation（現M3 USA Corporation）設立
- 11月「m3 MT」提供開始
- 2004年4月医師向け求人求職支援サービス「m3.com CAREER」提供開始
- 9月東京証券取引所マザーズ市場上場
- 2005年6月韓国Medi C&C Co.,Ltd.を子会社化
- 9月「QOL君」提供開始
- 12月初のコンシューマー向けサービス「AskDoctors」提供開始
- 2006年6月アメリカMDLinx, Inc.を子会社化
- 2007年3月東京証券取引所市場第一部へ上場市場を変更
- 2008年6月アイチケット株式会社を子会社化
- 2009年3月So-net M3 USA CorporationがMDLinx, Inc.を吸収合併
- 4月メビックス株式会社を子会社化
- 12月エムスリーキャリア株式会社を設立
- 2010年1月エムスリー株式会社へ商号変更
- 2011年8月イギリスDoctors.net.uk Limitedを子会社化
